Análisis de metilación del ADN por EpiTYPER®

En Making Genetics apostamos para los estudios dirigidos de metilación de ADN por la tecnología de análisis EpiTYPER® de Agena Bioscience (anteriormente Sequenom®) que le permite de una manera precisa, rápida y económica interrogar decenas de sitios CpG en amplicones de hasta 600 pb y detectar hasta un 5% en las diferencias en la metilación.

EpiTYPER comienza con el tratamiento con bisulfito del ADN genómico, seguido por amplificación por PCR de las regiones de destino utilizando cebadores con una etiqueta del promotor T7. A continuación, se lleva a cabo la transcripción in vitro del ARN, seguido por una escisión base-específica del ARN. Por último, los productos de escisión se analizan usando espectrometría de masas MALDI-TOF (MassARRAY Analyzer). Los residuos de citosina metilados y no metilados en el ADN genómico original, se distinguen fácilmente usando EpiTYPER Software.

 El software EpiTYPER minimiza el diseño manual y la optimización del ensayo, sin necesidad de diseñar cebadores específicos de CpG. Además, un flujo de trabajo optimizado reduce el tiempo experimental y la variabilidad no deseada, lo que le permite pasar de ADN tratado con bisulfito de datos en menos de 8 horas.

Aplicaciones

• Validar estudios de asociación epigenómico (EGWAS) a través de un mayor número de muestras para determinar el valor predictivo de los biomarcadores para el diagnóstico clínico de rutina.

• Analizar patrones de metilación diferencial entre casos y controles, no importando la especie de la muestra.

• Estudio de los cambios de metilación aberrante en el inicio del tumor y la progresión del cáncer.

• Estudio de las características hereditarias influenciadas por el medio ambiente de las generaciones anteriores.

 
Se pueden consultar los artículos publicados utilizando esta tecnología AQUI.
 

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